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　　免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是以抗體和抗原之間的專(zhuān)一性作用為基礎的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細胞內生理性相互作用的有效方法。其原理是：當細胞在非變性條件下被裂解時(shí)，完整細胞內存在的許多蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來(lái)。如果用蛋白質(zhì)X的抗體免疫沉淀X，那么與X在體內結合的蛋白質(zhì)Y也能沉淀下來(lái)。目前多用精制的proreinA預先結合固化在argarose的beads上，使之與含有抗原的溶液及抗體反應后，beads上的proreinA就能吸附抗原達到精制的目的。這種方法常用于測定兩種目標蛋白質(zhì)是否在體內結合；也可用于確定一種特定蛋白質(zhì)的新的作用搭檔。

　　其優(yōu)點(diǎn)為：

　?。?）相互作用的蛋白質(zhì)都是經(jīng)翻譯后修飾的，處于天然狀態(tài)；

　?。?）蛋白的相互作用是在自然狀態(tài)下進(jìn)行的，可以避免人為的影響；

　?。?）可以分離得到天然狀態(tài)的相互作用蛋白復合物。

　　缺點(diǎn)為：（1）可能檢測不到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)相互作用；

　?。?）兩種蛋白質(zhì)的結合可能不是直接結合，而可能有第三者在中間起橋梁作用；

　?。?）必須在實(shí)驗前預測目的蛋白是什么，以選擇最后檢測的抗體，所以，若預測不正確，實(shí)驗就得不到結果，方法本身具有冒險性。